Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cds1P98191 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms