Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VldlrP98156 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms