Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms