Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Npas2P97460 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms