Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3aP97351 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3aP97351 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps3aP97351 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3aP97351 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3aP97351 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3aP97351 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps3aP97351 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps3aP97351 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms