Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgcdP82347 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgcdP82347 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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