Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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