Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms