Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stra8P70278 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms