Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chl1P70232 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Chl1P70232 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chl1P70232 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Chl1P70232 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms