Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms