Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SbdsP70122 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms