Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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