Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pou3f4P62515 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms