Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm3P62311 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm3P62311 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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