Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rps29P62274 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rps29P62274 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rps29P62274 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms