Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Copz1P61924 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Copz1P61924 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copz1P61924 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copz1P61924 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copz1P61924 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copz1P61924 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Copz1P61924 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Copz1P61924 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Copz1P61924 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Copz1P61924 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copz1P61924 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms