Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr2fP61219 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr2fP61219 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms