Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arf3P61205 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms