Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2d1P61080 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms