Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms