Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms