Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms