Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rin3P59729 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms