Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NcstnP57716 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NcstnP57716 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms