Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rp1P56716 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms