Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AgrpP56473 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms