Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1bbP56400 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms