Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab8aP55258 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab8aP55258 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab8aP55258 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab8aP55258 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab8aP55258 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab8aP55258 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab8aP55258 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab8aP55258 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab8aP55258 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab8aP55258 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab8aP55258 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms