Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms