Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Faf1P54731 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms