Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms