Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lbx1P52955 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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