Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp1P52624 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms