Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp10P52479 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp10P52479 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms