Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnfP51944 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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