Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms