Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms