Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1swP51491 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Opn1swP51491 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1swP51491 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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