Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpbP50405 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpbP50405 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms