Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms