Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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