Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms