Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VegfbP49766 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfbP49766 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms