Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hnf4aP49698 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hnf4aP49698 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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