Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PtpreP49446 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PtpreP49446 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtpreP49446 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtpreP49446 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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PtpreP49446 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpreP49446 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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