Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms