Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx2P48031 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms