Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr7P47774 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr7P47774 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms