Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ItgavP43406 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms